В 2000 году при Министерстве здравоохранения Российской Федерации на комплексе «Байконур» была создана Медико-санитарная часть №2, на базе которой в 2006 году было основано Федеральное государственное учреждение здравоохранения «Центральная медико-санитарная часть №1» Федерального медико-биологического агентства. За 10 лет коллектив прошел большой путь развития и реформирования. В 2007-2008 годах учреждение расширилось за счет ряда бывших военных медицинских структур и учреждений здравоохранения города Байконур. Входящая в его состав Больница № 1 оказывает специализированную помощь взрослому и детскому населению в области хирургических, инфекционных, гинекологических и иных заболеваний. Больница № 2 имеет акушерско-гинекологический и педиатрический профиль. Поликлиника № 1 работает по цеховому принципу, основу ее пациентов составляют работники предприятий Роскосмоса, имеющие свои филиалы и представительства на комплексе «Байконур», а также работники предприятий и учреждений города Байконур. Поликлиника № 2 и Детская поликлиника обслуживают население по участковому принципу.
В составе ФГУЗ ЦМСЧ № 1 ФМБА России функционирует Противотуберкулезный диспансер и Станция скорой медицинской помощи.
Учреждение участвует в системе обязательного медицинского страхования, оказывает медицинские услуги на платной основе, активно участвует в практической реализации Приоритетного Национального Проекта «Здоровье».
В 2009 году специалисты ЦМСЧ №1 принимали участие в медицинском сопровождении всех 24 запусков космических аппаратов, проводимых с космодрома «Байконур», в 2010 году – более чем в 20-ти. Из них наиболее показательны запуски по программам пилотируемой космонавтики и ГЛОНАСС.
Специалисты ЦМСЧ №1 проводят большую работу по профилактике профессиональных заболеваний, медико-санитарному обеспечению специальных работ, проводимых на заправочных и стартовых позициях космодрома, участвуют в деятельности аварийно-спасательных формирований и групп (АСГ), предназначенных для ликвидации последствий возможных чрезвычайных ситуаций на объектах космодрома.
4 декабря в городском Дворце культуры состоялось торжественное мероприятие, посвященное 10-летию ЦМСЧ. Открыл торжественное мероприятие начальник ФГУЗ ЦМСЧ №1 ФМБА России Владимир Шкуропат. Он подвел итоги работы медсанчасти за прошедшие годы, поблагодарил всех сотрудников за добросовестный труд, отметив, что, несмотря на трудности, байконурские врачи достойно выполняют свою работу. Приветствие и поздравления в адрес медицинских работников Байконура со сцены ГДК прозвучали от заместителя руководителя ФМБА России Владимира Рогожникова, заместителя главы городской администрации Анатолия Петренко, руководителей предприятий Роскосмоса, представительства РК на комплексе «Байконур», силовых структур, городских предприятий, учреждений и организаций, духовенства.
Ряд сотрудников ЦМСЧ №1 за долголетний и добросовестный труд были отмечены благодарностями и награждены медалями, знаками, ценными подарками, грамотами, денежными премиями.
Отдел по связям со СМИ администрации г.Байконур